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肠易激综合征的病情反复发作，迁延日久，使病人失去信心，加上当今并无特效药物，又缺乏综合心理治疗，很多病人认为自己的病很难治好了，实际上并不是这样。
首先，树立战胜疾病的信心。正确认识该病是一种功能性疾病，是可以治愈的，对人体不会造成太大的伤害，也不会影响人的预期寿命。积极参加有益于自己身心健康的文体活动，消除精神和心理上的障碍，必要时在医师的指导下服用适量抗焦虑、抗抑郁和镇静药物。
其次，改善肠道内环境。可选用微生态制剂补充肠道内正常菌群。此外，同时服用谷氨酰胺类制剂，可促进肠黏膜细胞生长，尽快修复受损肠黏膜屏障。
然后，对症处理。对于腹泻型，抗胆碱能药物最为常用，对于腹泻严重者，可选用或同时加用一些药物，但要避免过量或长期应用，症状缓解即停药。对于便秘型，吗丁啉、莫沙必利、西沙比利等可改善腹胀和便秘，但患有心脏病的病人，应避免用西沙比利治疗。对于便秘、腹胀严重者，可用乳果糖口服或灌肠。
最后，匹维溴铵(得舒特)，对胃肠运动具有双向调节作用，临床上常用得舒特来治疗腹泻-便秘交替型，不但可以抑制肠道平滑肌活动，降低肠道收缩频率和幅度，降低肠道自发性直肠肛门抑制反射频率，同时得舒特还可抑制内在神经释放乙酰胆碱，防止IBS中过度的胆碱能活动，故可改善IBS患者腹痛、腹泻的症状，尤其是治疗初期疗效显著。
另外还有酶替代疗法。一些病人也可存在肠胃消化酶的不足，尤其是对食物不耐受者，常常因消化不良和吸收障碍，引起腹胀、腹泻等症状。予以多种消化酶制剂，对于肠易激综合征的改善是百利而无一害的。
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